Los microscopios estéreo se ramifican de otros microscopios de luz para la aplicación de la visualización de objetos "3D". Estos incluyen especímenes sustanciales, tales como insectos, plumas, hojas, rocas, granos de arena, gemas, monedas y sellos, etc. Funcionalmente, un microscopio estéreo es como una lupa poderosa. A diferencia de un microscopio compuesto que ofrece una imagen plana, los microscopios estéreo dan al espectador una imagen tridimensional que puede ver la textura de una muestra más grande.